Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms