Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms