Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms