Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms