Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms