Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms