Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fyco1Q8VDC1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms