Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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