Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms