Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rdh10Q8VCH7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh10Q8VCH7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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