Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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