Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms