Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpm8Q8R4D5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms