Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms