Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms