Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms