Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcho1Q8K285 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms