Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1T1

Lrrc25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc25Q8K1T1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc25Q8K1T1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc25Q8K1T1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms