Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnppd1Q8K158 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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