Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms