Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp1Q8K021 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms