Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rasgef1bQ8JZL7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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