Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Card11Q8CIS0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms