Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps50Q8CI71 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms