Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hpf1Q8CFE2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Hpf1Q8CFE2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Hpf1Q8CFE2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hpf1Q8CFE2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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Hpf1Q8CFE2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hpf1Q8CFE2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hpf1Q8CFE2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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