Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms