Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8CC96 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8CC96 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8CC96 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8CC96 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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