Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phtf2Q8CB19 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phtf2Q8CB19 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms