Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms