Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn7l2Q8C8K6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms