Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Aph1bQ8C7N7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Aph1bQ8C7N7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Aph1bQ8C7N7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Aph1bQ8C7N7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Aph1bQ8C7N7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Aph1bQ8C7N7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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