Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp20Q8C6M1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp20Q8C6M1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms