Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe22Q8C6A8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms