Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms