Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trerf1Q8BXJ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms