Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms