Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf3Q8BQU3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms