Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BP99 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BP99 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Q8BP99 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Q8BP99 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Q8BP99 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BP99 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Q8BP99 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Q8BP99 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Q8BP99 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BP99 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Q8BP99 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BP99 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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