Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms