Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms