Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clrn3Q8BHH8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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