Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms