Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms