Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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