Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atg4bQ8BGE6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atg4bQ8BGE6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atg4bQ8BGE6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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