Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Htatsf1Q8BGC0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Htatsf1Q8BGC0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Htatsf1Q8BGC0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms