Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms