Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU0

Rspo2, R-spondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo2Q8BFU0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rspo2Q8BFU0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms