Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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