Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms